孔子研究院是经国务院（国办函[1996]66号文）批准建设的一项大型文化工程，山东省“九五”发展规划中精神文明建设的重点工程，是一处具有较高层次的儒学研究机构。该工程具有博物展览、文献收藏、学术研究、信息交流、人才培训五项功能。 一是博物展览。与孔庙、孔府、孔林等地面建筑及库存文物统一规划和利用，举办孔子生平展和孔府文物精品展。使其成为一座充分显示东方文化特色的“孔子文化博物馆”；二是文献收藏。搜集、整理、汇编、存储古今中外浩如烟海的孔子及儒学文献资料，建成现代化的综合性孔子文献资料中心；三是学术研究和学术交流。接收国内外学者长期、短期、临时性学术研究，举办各种专题的国际性、双边性的学术讨论会；四是孔子及儒学研究信息交流。用现代化的设备和手段收储孔子及儒学研究动态，向国内外专家、学者提供研究信息；五是人才培训。聘请国内外知名人士任导师、研究院，开设多层次、多类型、多规格的培训班，接待国内外的访问学者等，为国内外学者提供良好的学习研究条件。